Inblandning av lövträd har stor betydelse för biologisk mångfald och för skogens upplevelsevärden, men skogsbruket gynnar ofta barrträd genom val av trädslag vid plantering och efterföljande röjning. Att antalet skogsbränder i skogslandskapet minskat har också missgynnat lövträd.
Naturvärdesbedömningar ska genomföras inför större skogliga åtgärder, normalt när det är barmark. Nyckelbiotoper ska undantas från alla skogsbruksåtgärder förutom åtgärder som krävs för att bevara eller främja biotopens biologiska mångfald.
FSC-certifierad skogsägare sparar minst fem procent av den produktiva skogen för naturvårdsändamål. Detta skapar utrymme för arter som inte trivs i den brukade skogen.
Många svenska skogsarter är beroende av bränder. I Sverige ska FSC-skogsbrukare med mer än 5000 hektar skog bränna en viss areal.
Många skogslevande arter är beroende av döda träd.
Genom att FSC ställer krav på en giftfri plantering har användningen av kemiska bekämpningsmedel mot snytbaggen upphört.